对比外部驱动式直线步进电机与线性导轨搭配使用的应用场景，直线步进电机具有其独特的优势，主要体现在以下3个方面：
允许更大的系统安装误差：
一般情况下，若使用外部驱动式直线步进电机，如果丝杆和导轨安装的平行度不佳，则很有可能导致系统卡滞。然而，使用直线步进电机，这种致命性的问题可以得到极大的改善，因为其设计的结构特性，可以允许更大的系统误差。
不受丝杆临界转速的限制：
选用外部驱动式直线步进电机做高速直线运动时，通常会被丝杆的临界转速所限制。然而，使用直线步进电机，固定丝杆并做防转，让电机带动线性导轨的滑块运行。由于丝杆是静止的，所以在实现高速时则不会受到丝杆临界转速的限制。
节省安装空间：
直线步进电机，因其螺母内置在电机里边的结构设计，不会额外占用丝杆长度之外的空间。可以在同一根丝杆上可安装多个电机，电机不能互相“通过”，但是其运动是互相独立的。因此，对于一些空间要求较为严苛的应用场合，是最佳的选择。
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